Le Blue Lagoon de Comino repose sur un plateau calcaire peu profond où le fond méditerranéen s'élève à moins de trois mètres, réfractant la lumière du soleil à travers une eau si transparente que les bateaux ancrés semblent suspendus dans les airs.
L'île de 3,5 kilomètres carrés — le plus petit territoire habité de Malte — abrite une population permanente de quatre personnes et aucune voiture, mais attire plus de 100 000 visiteurs chaque année dans son amphithéâtre turquoise. La clarté laiteuse du lagon résulte du sable fin de carbonate de calcium et de l'absence de sédiments organiques ; les vents dominants du nord-ouest rincent le bassin quotidiennement, maintenant une visibilité qui dépasse régulièrement quinze mètres.
Les départs de tours en bateau vers le Blue Lagoon de Gozo et Comino ont lieu depuis Ċirkewwa et Sliema depuis les années 1970, lorsque les pêcheurs locaux ont commencé à transporter des touristes en luzzu — bateaux en bois traditionnels peints avec l'Œil d'Osiris. Les croisières en catamaran modernes dominent désormais la route, leur conception à double coque offrant une stabilité à travers le détroit de huit kilomètres séparant Comino de la pointe nord de Malte. Le Crystal Lagoon, un second bassin à 400 mètres à l'est, reste encore plus peu profond — moins de deux mètres à son point le plus profond — et attire moins de foules malgré une qualité d'eau comparable. Entre les lagons, la tour Santa Marija s'élève à treize mètres au-dessus de la côte ; construite en 1618 comme la quatrième des fortifications côtières du Grand Maître Alof de Wignacourt, elle reste la seule tour de guet de Malte sur Comino et a servi de poste de signalisation jusqu'en 1829.
Des grottes marines entaillent les falaises occidentales de Comino dans une chaîne de deux kilomètres creusée par les houles hivernales qui atteignent trois mètres. Les grottes pénètrent jusqu'à trente mètres de profondeur dans le calcaire globigérine, exposant des strates riches en fossiles datant de l'Oligocène. La plupart des opérateurs de bateaux incluent un passage côtier sous les falaises, où les grottes encadrent des vues sur le chenal ouvert vers la côte sud de Gozo. Gozo elle-même — la deuxième plus grande île de Malte avec 67 kilomètres carrés — ancre de nombreux itinéraires d'une journée complète avec des arrêts au port de Mġarr ou des pauses baignade au large de la baie de Xlendi. L'itinéraire combiné trace une boucle de 25 kilomètres à travers la zone de conservation marine du chenal de Gozo, établie en 2014 pour protéger les prairies de zostères et les espèces endémiques, notamment la Posidonia oceanica protégée.
L'industrie des tours en bateau de Malte s'est développée rapidement après 2016, lorsque l'effondrement de l'Azure Window a redirigé l'attention des sites intérieurs de Gozo vers ses points d'accès côtiers. Les croisières vers le Blue Lagoon de Comino représentent désormais près d'un quart des réservations d'excursions marines à Malte, avec des capacités de catamaran allant de 40 à 120 passagers. Les créneaux de départ entre 08:00 et 10:00 offrent les traversées les plus calmes et l'accès au lagon le moins encombré, bien que les sorties de l'après-midi bénéficient de conditions de baignade plus chaudes et d'une lumière étendue sur les villes portuaires de Gozo. Le lagon lui-même reste gratuit d'accès, bien qu'un système de pass de débarquement de 2023 limite désormais les visiteurs quotidiens sur le rivage à 2 500 pendant les mois de pointe.
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